オミクロン株について

・オミクロン株は基準株と比較し、スパイクタンパク質に30か所のアミノ酸置換（以下、便宜的に「変異」と呼ぶ。）を有し、3か所の小欠損と1か所の挿入部位を持つ特徴がある。このうち15か所の変異は受容体結合部位（Receptor binding protein; RBD; residues 319-541）に存在する(ECDC. Threat Assessment Brief)。
・オミクロン株に共通するスパイクタンパク質の変異のうち、H655Y、N679K、P681HはS1/S2フリン開裂部位近傍の変異であり、細胞への侵入しやすさに関連する可能性がある。nsp6における105-107欠失はアルファ株、ベータ株、ガンマ株、ラムダ株にも存在する変異であり、免疫逃避に寄与する可能性や感染・伝播性を高める可能性がある。ヌクレオカプシドタンパク質におけるR203K、G204R変異はアルファ株、ガンマ株、ラムダ株にも存在し、感染・伝播性を高める可能性がある(Department Health, South Africa. SARS-CoV-2 Sequencing & New Variant Update 25）。
（上記、２０２１年１１月２８日 国立感染症研究所より抜粋）


現在おりーぶ薬局で販売中の医療用抗原検査キット（チェックMR-COV19【ロート製薬株式会社製造】）は新型コロナウイルスの「ヌクレオカプシドタンパク質」を検知して陽性かどうか判定します。
オミクロン株は既存の株と比較してスパイクタンパク質が３０か所変異しましたが、既存のアルファ株、ベータ株、ガンマ株、ラムダ株と同様のヌクレオカプシドタンパク質を有しています。
そのため、オミクロン株に関しても今までの株と同様に検出が可能です。

【コロナウイルスの構造】